Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/5064
Title: Proteomic changes during boron tolerance in barley (Hordeum vulgare) and the role of vacuolar proton-translocating ATPase subunit E
Other Titles: Boron toleransı sırasında arpada (Hordeum vulgare) görülen proteomik değişimler ve vakuol proton translokasyon ATPaz alt birim E’nin rolü
Authors: Atik, Ahmet Emin
Bozdağ, Gönensin Ozan
Akıncı, Ersin
Kaya, Alaattin
Koç, Ahmet
Yalçın, Talat
Karakaya, Hüseyin Çağlar
Atik, Ahmet Emin
Bozdağ, Gönensin Ozan
Akıncı, Ersin
Kaya, Alaattin
Koç, Ahmet
Yalçın, Talat
Karakaya, Hüseyin Çağlar
Izmir Institute of Technology. Molecular Biology and Genetics
Keywords: Boron stress
Hordeum vulgare
Proteomics
Saccharomyces cerevisiae
V-ATPase
Issue Date: 2011
Publisher: Türkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences
Source: Atik, A.E., Bozdaǧ, G.O., Akıncı, E., Kaya, A., Koç, A., Yalçın, T., and Karakaya, H. Ç. (2011). Proteomic changes during boron tolerance in barley (Hordeum vulgare) and the role of vacuolar proton-translocating ATPase subunit E. Turkish Journal of Botany, 35(4), 379-388. doi:10.3906/bot-1007-29
Abstract: Boron is an essential micronutrient for plants and animals; however, it can be toxic when present at high concentrations. The purpose of this study was to understand the mechanisms of boron tolerance in the Turkish barley (Hordeum vulgare) Anadolu cultivar. For this purpose, 2-dimensional electrophoresis (2-DE) was used to screen differentially expressed proteins for both control and boron-stressed Anadolu barley genotypes. Seven proteins were revealed by 2-DE: 1) ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCo large chain), 2) TLP5, a thaumatin-like protein, 3) PR5, a basic pathogenesis-related protein, 4) a RNase S-like protein, 5) a PSI type III chlorophyll a/b-binding protein, 6) a light-harvesting complex I LHC I, and 7) the vacuolar proton-translocating ATPase subunit E protein. These were found to be upregulated in response to boron treatment. Even though the protein encoded by the V-ATPase subunit E gene was overexpressed, its transcript level was downregulated by boron treatment. Heterologous expression of the barley V-ATPase subunit E gene in yeast provided boron resistance to yeast cells. These results indicated that the V-ATPase subunit E gene was functional and conferred tolerance to toxic boron levels in yeast and might play a role in the overall boron tolerance of barley. © TÜBITAK.
Bor, bitkiler ve hayvanlar için gerekli olan mikrolementlerdendir. Ancak yüksek konsantrasyonlarda toksik etki göstermektedir. Bu çalışmada bora dayanıklı Anadolu arpa (Hordeum vulgare) genotipindeki bor tolerans mekanizmasının anlaşılması amaçlanmıştır. Kontrol ve bor stresi uygulanmış ve Anadolu genotipi arasındaki farklı seviyede ekspres olan proteinleri taramak için 2 boyutlu elektroforez tekniği uygulanmıştır. İki boyutlu elektroforez deneyi sonucu ekspresyon seviyesi artan yedi protein bulunmuştur: ribuloz 1,5-bifosfat karboksilaz/oksijenaz büyük zincir, thaumatin benzeri protein TLP5, patojenaz benzeri protein PR5, RNaz S benzeri protein, PSI tipi III a/bbağlayıcı protein, ışık toplayan kompleks protein I LHC I ve vakuol proton translokasyon ATPaz alt birim E. V-ATPaz alt birim E geni tarafından kodlanan proteinin seviyesinin bor uygulaması ile artmasına rağmen, genin transkript seviyesi azalmıştır. Arpa V-ATPaz alt birim E geninin maya hücrelerinde ifadenlenmesi maya hücrelerine bora karşı dayanıklılık sağlamıştır. Bu sonuçlar, V-ATPaz alt birim E geninin mayada fonksiyonel olduğunu ve maya hücrelerine, toksik bor seviyelerine karşı dayanıklılık sağladığını ve de arpada bor toleransında bir rolü olabileceğini göstermektedir.
URI: https://doi.org/10.3906/bot-1007-29
http://hdl.handle.net/11147/5064
ISSN: 1300-008X
1300-008X
1303-6106
Appears in Collections:Chemistry / Kimya
Molecular Biology and Genetics / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu / Scopus Indexed Publications Collection
TR Dizin İndeksli Yayınlar / TR Dizin Indexed Publications Collection
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu / WoS Indexed Publications Collection

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
5064.pdfMakale877.97 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open
Show full item record

CORE Recommender

SCOPUSTM   
Citations

11
checked on Jun 19, 2021

WEB OF SCIENCETM
Citations

10
checked on Jun 19, 2021

Google ScholarTM

Check

Altmetric


Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.