Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/6877
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorYalçın Özuysal, Özdenen_US
dc.contributor.authorİlhan, Mustafa-
dc.dateinfo:eu-repo/date/embargoEnd/2021-01-23
dc.date.accessioned2018-04-12T07:16:11Z
dc.date.available2018-04-12T07:16:11Z
dc.date.issued2017-12
dc.identifier.citationİlhan, M. (2017). CYR61-notch interaction during epithelial-to-mesenchymal transition, migration and invasion in breast cancer cells. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkeyen_US
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11147/6877
dc.descriptionThesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2017en_US
dc.descriptionFull text release delayed at author's request until 2021.01.23en_US
dc.descriptionIncludes bibliographical references (leaves: 33-41)en_US
dc.descriptionText in English; Abstract: Turkish and Englishen_US
dc.description.abstractNotch signaling is one of the major pathways involved in development and tumorigenesis. Activated Notch is correlated with increased migration, invasion and epithelial-to-mesenchymal-transition (EMT) in breast cancer. However, mechanism of Notch-mediated cancer progression is poorly understood. CYR61 is a secreted protein and its upregulation is also related to increased breast tumorigenesis and EMT. Microarray analyses revealed that CYR61 was differentially expressed in response to Notch activation in breast epithelial cells. We hypothesized that CYR61 is a downstream mediator of Notch during EMT, migration and invasion. To test whether Notch requires CYR61 during EMT, migration and invasion, two complementary approaches were followed: (i) CYR61 expression was silenced by using shRNA in MCF10A epithelial breast cell line in the presence of Notch activation, (ii) CYR61 was over-expressed in MDA-MB-231 cancer breast cell line in the absence of Notch activity. Then, expression of EMT markers was analyzed in mRNA and protein levels via RT-qPCR and immuno-blotting, respectively. Migration and invasion ability of cells were investigated by wound healing assay and a lab-on-a-chip-system, respectively. Here, it was shown that CYR61 inhibition decreased Notch-induced EMT, migration and invasion of MCF10A and CYR61 overexpression in the absence of Notch activity partially rescued Notch-mediated invasion in MDA-MB-231 cell lines. Our findings suggest that CYR61 may act in downstream of Notch and is regulated by Notch. When we consider importance of CYR61 in Notch-induced EMT and cancer progression, targeting CYR61 may hold promise to develop novel strategies for treatment of breast cancer in early stages.en_US
dc.description.abstractNotch sinyal yolağı gelişim ve tümör oluşumunda yer alan ana yolaklardan biridir. Notch aktivasyonu meme kanserinde migrasyon, invazyon ve mezenkimal geçiş (EMT) ile ilişkilidir. Fakat Notch aracılığıyla kanser gelişiminin mekanizması tam olarak anlaşılamamıştır. CYR61 salgılanan bir proteindir ve fazla ifadelenmesinin meme tümörleşmesi ile ilgili olduğu bilinmektedir. Microarray analizi CYR61 geninin Notch aktivasyonuyla farklı ifadelendiği açığa çıkarmıştır. Bu tez çalışmasında, CYR61’in EMT, migrasyon ve invazyon sırasında Notch alt aracısı olduğu hipotez edilmiştir. Notch yolağının EMT, migrasyon ve invazyon sırasında CYR61 e ihtiyacı olup olmadığını anlamak için iki tamamlayıcı yaklaşım takip edildi: (i) MCF10A epitelyum meme hücre hattında Notch varlığında CYR61 ifadelenmesi shRNA kullanılarak susturuldu, (ii) MDA-MB-231 meme kanseri hücre hattında Notch eksikliğinde CYR61 fazla ifadelendi. Sonrasında, EMT belirteçlerinin ifadelenmesi mRNA ve protein seviyesinde sırasıyla RT-qPCR ve immün-blotlama yöntemleriyle analiz edilmiştir. Hücrelerin migrasyon ve invazyon yetenekleri sırasıyla yara iyileşme analizi ve lab-ona- chip sistemi ile araştırıldı. Burada, CYR61’in MCF10A hücre hattında Notch tarafından indüklenen EMT, migrasyon ve invazyonda önemli olduğu ve Notch aktivitesi olmadığında CYR61 in fazla ifadelenmesinin Notch tarafından indüklenen invazyonu MDA-MB-231 kanser hücrelerinde kısmi olarak kurtardığı gösterilmiştir. Bu bulgular CYR61 in Notch yolağının alt mekanizmasında rol alabileceğini ve Notch tarafından kontrol edilebileceğini önermektedir. CYR61’in Notch tarafından indüklenen EMT ve kanser gelişimdeki önemi düşünüldüğünde, CYR61’in hedef alınması, meme kanserini erken aşamalarda tedavi etmek için yeni tedavi stratejileri geliştirmede ümit vaat etmektedir.en_US
dc.format.extentix, 41 leavesen_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherIzmir Institute of Technologyen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessen_US
dc.subjectBreast canceren_US
dc.subjectCancer cellsen_US
dc.subjectCYR61en_US
dc.subjectNotch signalingen_US
dc.titleCYR61-notch interaction during epithelial-to-mesenchymal transition, migration and invasion in breast cancer cellsen_US
dc.title.alternativeMeme kanseri hücrelerinde mezenkimal geçiş (EMT), migrasyon ve invazyon sırasında CYR61-notch etkileşimien_US
dc.typeMaster Thesisen_US
dc.institutionauthorİlhan, Mustafa-
dc.departmentIzmir Institute of Technology. Molecular Biology and Geneticsen_US
dc.request.emailmustafailhan.060@gmail.com
dc.request.fullnameMustafa İlhan
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
item.openairetypeMaster Thesis-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.fulltextWith Fulltext-
item.grantfulltextopen-
item.languageiso639-1en-
item.cerifentitytypePublications-
Appears in Collections:Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
T001715.pdfMasterThesis4.31 MBAdobe PDFThumbnail
View/Open
Show simple item record

CORE Recommender

Page view(s)

18
checked on Nov 28, 2021

Download(s)

14
checked on Nov 28, 2021

Google ScholarTM

Check


Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.