Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/11147/6575
Title: | Investigation of the effects of HIV-1 and SIV AGM TAT proteins on SLPI gene expression in Chlorocebus sabaeus kidney (Vero) cell line | Other Titles: | Chlorocebus sabaeus böbrek (Vero) hücre hattında HIV-1 ve SIV AGM TAT proteinlerinin SLPI gen ekspresyonu üzerindeki etkisinin araştırılması | Authors: | Özkan, Aysu | Advisors: | Arslanoğlu, Alper | Keywords: | HIV-1 Chlorocebus sabaeus African Green monkey Secretory Leukocyte Protease Inhibitor HIV-1 TAT protein |
Publisher: | Izmir Institute of Technology | Source: | Özkan, A. (2017). Investigation of the effects of HIV-1 and SIV AGM TAT proteins on SLPI gene expression in Chlorocebus sabaeus kidney (Vero) cell line. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey | Abstract: | Even though Human Immunodeficiency Virus (HIV) can infect Old World Monkey
(i.e African Green Monkey) cells, replication of the virus is hampered with different
kinds of restriction mechanisms before the integration of viral genome to host genome.
After viral integration to host genome, HIV-1 TAT protein is expressed, which plays an
important role for the generation of other proteins for viral production. Previous studies
which were performed in our laboratory indicate that Secretory Leukocytes Protease
Inhibitor (SLPI) overexpressed in existence of HIV-1 TAT protein. This result was confirmed
with 2D-PAGE, qRT-PCR and Western Blot Analysis. The aim of this study is
to understand how Vero Stable Cell Lines which produces HIV-1 TAT protein can affect
expression levels of SLPI. At mRNA level of SLPI expression was confirmed with qRTPCR.
In order to measure SLPI expression at the protein level in the presence of HIV-1
TAT,Western Blot and Sandwich Elisa methods were used. Luciferase Assay process was
performed in order to measure the effects of SLPI on HIV-LTR. Consequently, expression
of SLPI in Vero Stable Cell Line increased in the existence of HIV-1 TAT protein. Additionally,
SLPI inhibits HIV-LTR function through suppressing NF- κB promoter which
exists in HIV-LTR. Insan Bağışıklık Yetmezlği Virüsü (HIV) Eski Dünya Maymunu (örneğin Afrika Yeşil Maymunu) hücrelerine girse bile, virüsün çoğalması viral genom konakçı hücre genomuna entegre olmadan çeşitli engelleyici mekanizmalarla engellenir. Konakçı genomuna viral genomun entegre olmasından sonra, virüs çoğalmasında diğer proteinlerin ortaya çıkmasında önemli rol oynayan HIV-1 TAT protein eksprese edilir.. Laboratuvarımızda gerçekleşen önceki çalışmalar SLPI geninin HIV-1 TAT protein varlığında çok fazla eksprese olduğu göstermiştir. Bu sonuç, 2D-PAGE, qRT-PCR ve Western Blot yöntemleriyle doğrulanmıştır. Bu çalışmanın amacı, HIV-1 TAT protein üreten, transfekte edilmiş Vero stabil Hücre Hatlarında SLPI ekspresyon seviyesinin nasıl etkilendiğini anlamaktır. SLPI ekspresyonu mRNA seviyesinde qRT-PCR ile doğrulanmıştr. HIV-1 TAT varlığında SLPI ekspresyon seviyesinin protein seyiyesinde ölçmek için Western Blot, Sandwich Elisa yöntemleri kullanılmıştır. SLPI HIV-LTR üzerindeki etkisini ölçmek için Lüsiferaz Analizi yapılmıştır. Sonuç olarak, transfekte edilmiş Vero Stabil Hücre Hatları’nda SLPI ekspresyonu HIV-1 TAT proteini varlığında artar. Buna ek olarak, SLPI HIV-LTR işlevini HIV-LTR içinde bulunan NF-κB promotorunu baskılayarak engeller. |
Description: | Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2017 Includes bibliographical references (leaves: 61-67) Text in English; Abstract: Turkish and English |
URI: | http://hdl.handle.net/11147/6575 |
Appears in Collections: | Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
T001591.pdf | MasterThesis | 3.9 MB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s)
226
checked on Nov 18, 2024
Download(s)
102
checked on Nov 18, 2024
Google ScholarTM
Check
Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.