Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/13928
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorYalçın Özuysal, Özdentr
dc.contributor.authorTosunoğlu, Perge Bilgesutr
dc.date.accessioned2023-11-03T08:25:08Z-
dc.date.available2023-11-03T08:25:08Z-
dc.date.issued2023-07en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11147/13928-
dc.descriptionThesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molekular Biology and Genetics, Izmir, 2023en_US
dc.descriptionIncludes bibliographical references (leaves. 49-52)en_US
dc.descriptionText in English; Abstract: Turkish and Englishen_US
dc.description.abstractThere are many challenges in creating an accurate and physiologically relevant three-dimensional (3D) model of the liver such as finding the suitable liver extracellular matrix (ECM) components and cell types for the development of cell-laden liver-on-a-chip systems. In recent years, precision tissue slice-based methods are used to reduce the problems caused by the cell-laden liver-on-a-chip system complexity. However, these methods require sophisticated tools which are not easily accessible. This study focuses on the development of a 3D liver model using simple and cost-effective methods. To achieve this, we aimed to optimize liver tissue size, maintenance and culture medium, scaffold gel, and viability assay. The needle method was found to be the easiest, most efficient, and cheap method for tissue processing as the equipment used was easily accessible and evaded enzymatic steps. Moreover, consistent samples that were all similar and in the desired size were easy to obtain. In addition to these, functionality and viability were analysed for 72 hours to assess the physiological state of the liver after tissue processing. Based on these findings a novel liver-on-a-chip system was successfully developed and as the next step, the invasion of the MDA-MB-231 breast cancer cell line towards the liver was investigated with and without the presence of C-X-C chemokine receptor type 4 (CXCR4) antagonists AMD3100 and AMD3465. In conclusion, this study demonstrated the development of a novel 3D model for the liver and provided a platform for studying breast cancer invasion with its potential implications for cancer therapy research.en_US
dc.description.abstractKaraciğer fizyolojisini yansıtan bir 3B hücre yüklü yonga-üzeri-karaciğer sistemlerinin geliştirilmesinde, uygun karaciğer hücre dışı matris (ECM) bileşenlerinin ve hücre tiplerinin belirlenmesi gibi zorluklarla karşılaşılmaktadır. Son yıllarda, bu soruna yönelik çözüm olarak doku dilimi tabanlı yöntemler kullanılmaktadır. Ancak bu yöntemler, kolayca erişilemeyen karmaşık ve ileri teknoloji cihazlar gerektirmektedir. Bu çalışma, basit ve uygun maliyetli yöntemler kullanarak 3B karaciğer modeli geliştirmesine odaklanmaktadır. Bunu başarmak için karaciğer dokusu boyutunun, bakım ve kültür ortamının, jel ortamının ve canlılık testinin optimize edilmesi amaçlanmıştır. Kullanılan ekipmanın kolay erişilebilir olması ve enzimatik basamaklara gerek kalmaması nedeniyle iğne yönteminin en kolay, verimli ve ucuz yöntem olduğu ortaya konmuştur. Ayrıca, bu yöntem ile hepsi birbirine benzeyen ve istenen boyutta tutarlı örnekler elde edilmesi mümkün olmuştur. Bunlara ek olarak, doku işleme adımlarından sonra karaciğerin fizyolojik durumunu değerlendirmek için 72 saat boyunca işlevsellik ve canlılık kontrol edilmiştir. Bu bulgulara dayanarak, yeni bir yonga-üzeri-karaciğer sistemi başarılı bir şekilde geliştirilmiştir. Ardından, geliştirilen sistem kullanılarak MDA-MB-231 meme kanseri hücre hattının karaciğere doğru invazyonu, C-X-C kemokin reseptörü tip 4 (CXCR4) antagonistleri AMD3100 ve AMD3465 varlığında ve yokluğunda analiz edilmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma ile yeni bir 3B karaciğer modeli optimize edilerek kanser tedavisi araştırmalarında kullanılmak üzere meme kanseri invazyonunun incelenebileceği bir platform geliştirilmiştir.tr
dc.format.extentx, 52 leavesen_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisher01. Izmir Institute of Technologyen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessen_US
dc.subjectBreast cancer cellen_US
dc.subjectChip systemsen_US
dc.subjectLiver-on-a-chip systemsen_US
dc.titleOptimization of a liver organ on chip system for the investigation of breast cancer cell invasionen_US
dc.title.alternativeMeme kanseri hücrelerinin invazyon araştırmaları için bir karaciğer organ çipinin optimizasyonutr
dc.typeMaster Thesisen_US
dc.authorid0000-0002-4775-1325en_US
dc.departmentThesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Geneticsen_US
dc.relation.publicationcategoryTez-
dc.identifier.yoktezid823980en_US
item.fulltextWith Fulltext-
item.cerifentitytypePublications-
item.openairetypeMaster Thesis-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.grantfulltextopen-
item.languageiso639-1en-
Appears in Collections:Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
10565963.pdfMaster Thesis2.15 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

36
checked on May 20, 2024

Download(s)

34
checked on May 20, 2024

Google ScholarTM

Check





Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.