Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/13729
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorYücesoy, Deniz Tanılen_US
dc.contributor.advisorÖzçivici, Enginen_US
dc.contributor.authorKan, İlkeren_US
dc.date.accessioned2023-09-27T07:09:48Z-
dc.date.available2023-09-27T07:09:48Z-
dc.date.issued2023-06en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11147/13729-
dc.descriptionThesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Bioengineering, Izmir, 2023en_US
dc.descriptionIncludes bibliographical references (leaves. 56-82)en_US
dc.descriptionText in English; Abstract: Turkish and Englishen_US
dc.description.abstractTooth loss has been a widespread dental problem affecting patients of various ages. Replacement of lost teeth with implants is a common practice for managing tooth loss due to their mechanical properties and natural-looking aesthetics. One of the persistent problems associated with dental implants is the risk of infection (periimplantitis) which can occur when bacteria colonize the implant surface leading to inflammation and tissue damage with an eventual implant failure. Infection-resistant antimicrobial coatings have been one of the promising solutions to combat implant infections. The purpose of this study was to design functional chimeric peptides using antimicrobial peptides and hydroxyapatite binding peptides in order to provide an antimicrobial effect to hydroxyapatite-coated titanium dental implants. For this purpose, since titanium implants coated with hydroxyapatite show long-term biocompatibility, chimeric peptides that can provide antimicrobial resistance have been designed by considering antimicrobial peptides in addition to these coatings. Computational analysis, solubility analysis, secondary structure analysis, and conformational change analysis were performed to examine the ability of these formed chimeric peptides to retain their antimicrobial properties. Promising candidates obtained from secondary structure analysis and solubility analysis were examined to preserve their structure and stability by performing conformational change analysis, and the most suitable candidates were decided. Although the results give candidates computationally according to the analysis, these candidates should be confirmed experimentally. When the results from the computational analysis are validated by the experimental analysis, it will set the standard for antimicrobial chimeric peptide design.en_US
dc.description.abstractDiş kaybı, çeşitli yaşlardaki hastaları etkileyen yaygın bir problem olmuştur. Kaybedilen dişlerin implantlarla değiştirilmesi, mekanik özellikleri ve doğal görünümlü estetikleri nedeniyle diş kayıplarını telafi etmek için yaygın bir uygulamadır. Dental implantlarla ilişkili kalıcı sorunlardan biri, bakterilerin implant yüzeyini kolonize ederek enflamasyona, doku hasarına ve nihai bir implant başarısızlığına yol açtığındaki ortaya çıkabilen enfeksiyon (peri-implantitis) riskidir. Enfeksiyona dirençli antimikrobiyal kaplamalar, implant enfeksiyonlarıyla mücadelede umut verici çözümlerden biri olmuştur. Bu çalışmanın amacı, hidroksiapatit kaplı titanyum dental implantlara antimikrobiyal etki sağlamak için antimikrobiyal peptidler ve hidroksiapatit bağlayıcı peptid kullanarak fonksiyonel kimerik peptidler tasarlamaktır. Bu amaç ile, hidroksiapatit ile kaplanmış Titanyum implantlar uzun vadeli biyouyumluluk gösterdiği için bu kaplamalara ek olarak antimikrobiyal peptitler ele alınarak antimikrobiyal direnç sağlayabilecek kimerik peptitler dizayn edilmiştir. Oluşturulmuş bu kimerik peptitlerin antimikrobiyal özelliklerini koruyabildiklerini incelemek için hesaplamalı olarak ikincil yapı analizi, çözünürlük analizi ve konformasyonel değişim analizi yapılmıştır. İkincil yapı analizi ve çözünürlük analizinden elde edilen umut vadeden adayların konformasyonel değişim analizi yapılarak yapısını ve stabilitesini korumaları incelenmiş olup en uygun adaylara karar verilmiştir. Sonuçlar, yapılan analizlere göre hesaplamalı olarak adayları veriyor olsa da bu adaylar deneysel olarak konfirme edilmelidir. Hesaplamalı analiz ile elde edilecek sonuçlar deneysel analiz ile valide edildiğinde antimikrobiyal kimerik peptit dizaynı için bir standart oluşturmuş olacaktır.en_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisher01. Izmir Institute of Technologyen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectDental implantsen_US
dc.subjectPeriimplantitisen_US
dc.subjectSurface coatingen_US
dc.subjectChimeric peptidesen_US
dc.titleIn silico design of chimeric peptides for infection resistant implant coatingsen_US
dc.title.alternativeEnfeksiyona dirençli implant kaplamaları için in silico kimerik peptit tasarımıen_US
dc.typeMaster Thesisen_US
dc.authorid0000-0001-5109-1297en_US
dc.departmentThesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Bioengineeringen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.identifier.yoktezid813173en_US
item.grantfulltextopen-
item.openairetypeMaster Thesis-
item.fulltextWith Fulltext-
item.cerifentitytypePublications-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.languageiso639-1en-
Appears in Collections:Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
10556525.pdfMaster Thesis6.95 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

54
checked on May 6, 2024

Download(s)

78
checked on May 6, 2024

Google ScholarTM

Check





Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.