Please use this identifier to cite or link to this item:
https://hdl.handle.net/11147/10979
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.advisor | Seyrantepe, Volkan | - |
dc.contributor.author | Can, Melike | - |
dc.date.accessioned | 2021-07-04T09:33:06Z | - |
dc.date.available | 2021-07-04T09:33:06Z | - |
dc.date.issued | 2020-07 | en_US |
dc.identifier.citation | Can, M. (2020). Investigation of combined biological roles of neuraminidase 1 and gm3 synthase enzymes in glycolipid metabolism. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey | en_US |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/11147/10979 | - |
dc.description | Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2020 | en_US |
dc.description | Includes bibliographical references (leaves: 128-142) | en_US |
dc.description | Text in English; Abstract: Turkish and English | en_US |
dc.description.abstract | Gangliosides are sialic acid-containing glycosphingolipids, and commonly expressed in nervous system. GM3 Synthase is responsible for production of GM3 ganglioside known as precursor of a- and b- series gangliosides. Sialidases catalyze removing of sialic acid residues from sialoglycoconjugates and classified based on subcellular localization. Lysosomal Neu1 sialidase is responsible for catabolism of glycolipids, glycoproteins and oligosaccharides. Mutations of lysosomal Neu1 sialidase cause sialidosis and Neu1-/- mice mimic symptoms seen in patients. Glycosphingolipid accumulation in visceral organs of sialidosis patients was notified previously, and it was also reported the GM3 ganglioside as substrate of lysosomal sialidase in vitro. However, effect of Neu1 sialidase in the case of complex ganglioside deficiency in brain remains unclear. In the concept of research, we aimed to understand biological role of lysosomal Neu1 sialidase alone and combined with GM3S in ganglioside metabolism in vivo. In accordance with this purpose, cortex, cerebellum and thalamus tissues of 2- and 5-month old Neu1-/-GM3S-/-, Neu1-/- and GM3S-/- mice were compared with age-matched control group using molecular biological, histological, immunohistochemistry and behavioral analyses. Alterations in ganglioside metabolism, oligosaccharide pattern and cellular processes (ER-oxidative stress, apoptosis), structural abnormalities, glycoconjugate accumulation, loss of neurons and oligodendrocytes in addition to age dependent behavioral impairments in motor function, memory and muscle strength were demonstrated in single and double knock-out mice. In regard of these results, we have concluded that altered glycosphingolipid metabolism with accumulated secondary metabolites like oligosaccharides affect cellular processes and brain pathology resulting in behavioral abnormalities in age dependent and region specific manner. | en_US |
dc.description.abstract | Gangliositler, sinir sisteminde yaygın olarak ifade edilen sialik asit içeren glikosifingolipitlerdir. GM3 Synthase a- ve b-serisi gangliositlerin üretimi için öncü olan GM3 gangliositinin üretiminden sorumludur. Sialidazlar, sialoglikokonjugatlardan sialik asit kalıntılarının uzaklaştırılmasını katalizlerler ve hücresel lokalizasyonlarına göre sınıflandırırlar. Lizozomal Neu1 sialidaz glikolipit, glikoprotein ve oligosakkaritlerin katabolizmasından sorumludur. Neu1 sialidaz mutasyonları, sialidoz hastalığına sebep olur ve Neu1 enzim eksikliğine sahip fareler hastalarda görülen semptomları taklit eder. Hastaların Neu1 sialidaz eksikliğine bağlı olarak iç organlarında glikosfingolipit birikimi önceki çalışmalarda gösterilmiş ve in vitro olarak lizozomal sialidaz substratının GM3 gangliositi olduğu bildirilmiştir. Fakat Neu1 sialidazının beyinde kompleks gangliositlerin eksikliğindeki rolü bilinmemektedir. Bu araştırmamız kapsamında, lizozomal Neu1 sialidazın tek başına ve GM3S ile birlikte beyindeki glikosfingolipit metabolizması üzerindeki biyolojik etkisini in vivo olarak anlamayı amaçladık. Bu amaç doğrultusunda, 2 ve 5 aylık Neu1-/-GM3S-/-, Neu1-/- ve GM3S-/- fare gruplarının korteks, beyincik ve talamus dokuları yaş eşleniği kontrol grubu ile moleküler biyolojik, histolojik, immunohistokimyasal ve davranış deneyleri yapılarak karşılaştırıldı. Glikolipit metabolizması, oligosakkarit paterni, hücresel süreçlerdeki (ER-oksidatif stres ve apoptoz) değişimler, yapısal bozukluklar, glikokonjügat birikimi, nöron ve oligodendrosit sayılarında azalma ve bunlara ek olarak motor fonksiyonunda, hafıza ve kas gücünde hasarlar gibi yaşa bağlı davranışsal bozukluklar tek ve çift gen eksikliğine sahip fare modellerinde gösterilmiştir. Bu sonuçlar doğrultusunda, glikolipit metabolizmasındaki değişiklikler ile birlikte oligosakkarit gibi sekonder metabolitlerin birikimi yaşa ve bölgeye bağlı çeşitli hücresel süreçleri ve beyin patolojisini etkileyip davranışsal bozukluklara sebep olduğu gösterilmiştir. | en_US |
dc.description.sponsorship | TUBITAK (117Z259) | en_US |
dc.format.extent | xv, 142 leaves | en_US |
dc.language.iso | en | en_US |
dc.publisher | Izmir Institute of Technology | en_US |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | en_US |
dc.subject | Lysosomes | en_US |
dc.subject | Sialidases | en_US |
dc.subject | Gangliosides | en_US |
dc.subject | Ganglioside synthase enzyme | en_US |
dc.subject | Lysosomal stroge disorders | en_US |
dc.title | Investigation of combined biological roles of neuraminidase 1 and gm3 synthase enzymes in glycolipid metabolism | en_US |
dc.title.alternative | Nörominidaz 1 ve gm3 sentaz enzimlerinin glikolipit metabolizmasındaki birleşik biyolojik rolünün araştırılması | en_US |
dc.type | Master Thesis | en_US |
dc.department | Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics | en_US |
dc.relation.tubitak | info:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/KBAG/117Z259 | - |
dc.relation.publicationcategory | Tez | en_US |
item.fulltext | With Fulltext | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.languageiso639-1 | en | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
item.openairetype | Master Thesis | - |
Appears in Collections: | Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri |
Files in This Item:
File | Size | Format | |
---|---|---|---|
10168445.pdf | 4.95 MB | Adobe PDF | View/Open |
CORE Recommender
Page view(s)
136
checked on Nov 18, 2024
Download(s)
206
checked on Nov 18, 2024
Google ScholarTM
Check
Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.