Bilgilendirme: Sürüm Güncellemesi ve versiyon yükseltmesi nedeniyle, geçici süreyle zaman zaman kesintiler yaşanabilir ve veri içeriğinde değişkenlikler gözlemlenebilir. Göstereceğiniz anlayış için teşekkür ederiz.
 

Studying Dopa Adhesion on Polystyrene Under Water

dc.contributor.advisor Akdoğan, Yaşar
dc.contributor.advisor Emrullahoğlu, Mustafa
dc.contributor.author Yıldız, Remziye
dc.contributor.other 03.09. Department of Materials Science and Engineering
dc.contributor.other 01. Izmir Institute of Technology
dc.contributor.other 04.04. Department of Photonics
dc.contributor.other 03. Faculty of Engineering
dc.contributor.other 04. Faculty of Science
dc.date.accessioned 2021-11-05T08:13:33Z
dc.date.available 2021-11-05T08:13:33Z
dc.date.issued 2021-06
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Materials Science and Engineering, Izmir, 2021 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves. 52-57) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Mussels wet adhesive performance has been arousing curiosity for a long time. It is found that 3,4-dihydroxyphenylalanine (DOPA) is responsible for adhesive properties of mussels. Despite a large body of research characterizing the interactions DOPA with hydrophilic surfaces, relatively few works have addressed the mechanism of interactions with hydrophobic surfaces. The benzene ring of DOPA is the main attributor to the adhesion on hydrophobic polystyrene (PS) surface. However, here we showed that two hydroxyl groups of catechol have also effects on wet adhesion. We studied wet adhesive properties of DOPA, tyrosine and phenylalanine functionalized PEG polymers, PEG-(N-Boc-L-DOPA)4, PEG-(N-Boc-L-Tyrosine)4, PEG-(N-Boc-L-Phenylalanine)4, on spin labeled PS nanobeads (SL-PS) by electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy. Surface coverage ratio of SL-PS upon additions of PEG-(N-Boc-L-DOPA)4, PEG-(N-Boc-L-Tyrosine)4 and PEG-(N-Boc-L-Phenylalanine)4 showed that SL-PS was covered with 70%, 50% and 0%, respectively. This showed that spontaneous wet adhesion on PS increases with the number of amino acids hydroxyl groups. This is also supported with the density functional theory (DFT) energy calculations and ab-initio molecular dynamics (AIMD) simulations. In water, interactions between water molecules and hydroxyl groups on the catechol induce catechol adhesion via π-π stacking between the catechol and double styrene rings which were already tilted out with water. en_US
dc.description.abstract Midyenin ıslak yapışkanlık performansı uzun zamandır merak uyandırmaktadır. Midyelerin yapışkan özelliklerinden 3,4-dihidroksifenilalaninin (DOPA) sorumlu olduğu bulunmuştur. DOPA'nın hidrofilik yüzeylerle etkileşimlerini karakterize eden araştırmalar bulunmasına rağmen, nispeten az sayıda çalışma hidrofobik yüzeylerle olan etkileşim mekanizmasına değinmiştir. DOPA'nın benzen halkası, hidrofobik polistiren (PS) yüzey üzerindeki yapışmaya ana katkı sağlar. Bununla birlikte, burada iki hidroksil katekol grubunun da ıslak yapışma üzerinde etkileri olduğunu gösterdik. Elektron paramanyetik rezonans (EPR) spektroskopisi ile spin etiketli PS nano tanecik (SL-PS) üzerinde DOPA, tirozin ve fenilalanin ile işlevselleştirilmiş PEG polimerlerinin, PEG-(N-Boc-L-DOPA)4, PEG-(N-Boc-L-Tirozin)4, PEG-(N-Boc-L-Fenilalanin)4, ıslak yapışkan özelliklerini inceledik. PEG-(N-Boc-L-DOPA)4, PEG-(N-Boc-L-Tirozin)4 ve PEG-(N-Boc-L-Fenilalanin)4 eklenmesi ile SL-PS'nin yüzey kaplanma oranı sırasıyla %70, %50 ve %0 olarak bulunmuştur. Bu, PS üzerindeki kendiliğinden gerçekleşen ıslak yapışmanın amino asit hidroksil gruplarının sayısı ile arttığını göstermiştir. Elde edilen sonuçlar yoğunluk fonksiyonel teorisi (DFT) enerji hesaplamaları ve ab-initio moleküler dinamik (AIMD) simülasyonları ile de desteklenmiştir. Su içerisinde, su molekülleri ve katekol üzerindeki hidroksil grupları arasındaki etkileşimler, katekol ve halihazırda suyla eğilmiş olan çift stiren halkaları arasındaki π-π yığılması yoluyla katekol yapışmasına neden olmaktadır. en_US
dc.format.extent xi, 64 leaves
dc.identifier.citation Yıldız, R. (2021). Studying dopa adhesion on polystyrene under water. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/11155
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.relation Su içerisinde DOPA'nın polistiren yüzeyine olan yapışkanlığının anlaşılması en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject DOPA en_US
dc.subject Polystyrene en_US
dc.subject Mussel foot proteins en_US
dc.subject Hydroxyl groups en_US
dc.title Studying Dopa Adhesion on Polystyrene Under Water en_US
dc.title.alternative Dopa'nın Su İçerisinde Polistirene Yapışma Çalışması en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Yıldız, Remziye
gdc.author.institutional Akdoğan, Yaşar
gdc.author.institutional Emrullahoğlu, Mustafa
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.contributor.affiliation 01. Izmir Institute of Technology en_US
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Materials Science and Engineering en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
relation.isAuthorOfPublication 23f14108-de2e-464d-a425-f0324cc80ca3
relation.isAuthorOfPublication 185bb326-a190-46d8-8fd5-9829ba97c9bc
relation.isAuthorOfPublication a0a3756c-8977-4835-98e6-00d06add57fb
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 23f14108-de2e-464d-a425-f0324cc80ca3
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4023-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4003-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4010-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4004-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4005-8abe-a4dfe193da5e
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4023-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
10406948.pdf
Size:
5.32 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Master Thesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
3.2 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: