Show simple item record

dc.contributor.authorBinici, Rıfkı Can
dc.contributor.authorŞahin, Umut
dc.contributor.authorAyanzadeh, Aydın
dc.contributor.authorTöreyin, Behçet Uğur
dc.contributor.authorÖnal, Sevgi
dc.contributor.authorOkvur, Devrim Pesen
dc.contributor.authorYalçın Özuysal, Özden
dc.contributor.authorÜnay, Devrim
dc.date.accessioned2020-07-18T03:35:04Z
dc.date.available2020-07-18T03:35:04Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.isbn9781728124209
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.1109/TIPTEKNO.2019.8895080
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11147/7789
dc.description2019 Medical Technologies Congress, TIPTEKNO 2019; Palm Wings Ephesus HotelIzmir; Turkey; 3 October 2019 through 5 October 2019en_US
dc.description.abstractPhase contrast optical microscopy is a preferred imaging technique for live-cell, temporal analysis. Segmentation of cells from time series data acquired with this technique is a labor-intensive and time-consuming task that cell biology researchers need solution for. In this study traditional image processing and deep learning based approaches for automated cell segmentation from phase contrast optical microscopy time series are presented, and their performances are evaluated against manually annotated datasets. © 2019 IEEE.en_US
dc.description.abstractFaz kontrast optik mikroskopi hücrelerin canlı ortamlarında zamana bağlı incelenmesi için tercih edilen görüntüleme yöntemidir. Bu yöntem ile elde edilen zaman serisi görüntülerinde hücrelerin bölütlenmesi işi hücre biyolojisi araştırmacılarının çözümüne ihtiyaç duyduğu emek yoğun ve zaman alan bir iştir. Bu çalışmada faz kontrast optik mikroskopi zaman serilerinde hücrelerin otomatik bölütlenmesi için geleneksel görüntü işleme ve derin öğrenme temelli yöntemler önerilmiş ve başarımları elle işaretlenmiş veri kümelerinde nicel olarak ölçülmüştür.
dc.language.isoengen_US
dc.publisherInstitute of Electrical and Electronics Engineersen_US
dc.relation.isversionof10.1109/TIPTEKNO.2019.8895080en_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectCell segmentationen_US
dc.subjectDeep learningen_US
dc.subjectPhase contrast optical microscopyen_US
dc.subjectSegNeten_US
dc.subjectTime seriesen_US
dc.titleFaz kontrast optik mikroskopi zaman serisi görüntülerinde hücrelerin otomatik bölütlenmesien_US
dc.title.alternativeAutomated segmentation of cells in phase contrast optical microscopy time series imagesen_US
dc.typeconferenceObjecten_US
dc.contributor.institutionauthorÖnal, Sevgi
dc.contributor.institutionauthorOkvur, Devrim Pesen
dc.contributor.institutionauthorYalçın Özuysal, Özden
dc.relation.journalTIPTEKNO 2019 - Tıp Teknolojileri Kongresien_US
dc.contributor.departmentIzmir Institute of Technology. Molecular Biology and Geneticsen_US
dc.identifier.scopusSCOPUS:2-s2.0-85075606705
dc.relation.publicationcategoryKonferans Öğesi - Uluslararası - Kurum Öğretim Elemanıen_US


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record