Show simple item record

dc.contributor.advisorDemir, Mustafa Muammeren_US
dc.contributor.advisorHorzum Polat, Nesrinen_US
dc.contributor.authorIsık, Tuğba
dc.date.accessioned2015-11-24T08:05:30Z
dc.date.available2015-11-24T08:05:30Z
dc.date.issued2015-07
dc.identifier.citationIsık, T. (2015). Circulating nucleic acid (CNA) separation from serum by electrospun membranes. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkeyen_US
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11147/4343
dc.descriptionThesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Material Science and Engineering, Izmir, 2015en_US
dc.descriptionIncludes bibliographical references (leaves: 52-60)en_US
dc.descriptionText in English; Abstract: Turkish and Englishen_US
dc.descriptionxiii, 63 leavesen_US
dc.description.abstractEarly detection of diseases is a key factor that can be made provision and successfully treated. There is a wide array of methods to diagnose cancer like biopsy, endoscopy, magnetic resonance imaging (MRI) and blood tests. In blood, while some nucleic acids are found in intracellular fluids, circulating nucleic acids (CNAs) circulate freely in extracellular fluids. They are located at genomic regions and increased levels of CNAs imply a connection with cancer and tumor initiation. For further analysis, separation and concentration of CNAs have high potential in early cancer detection. A model system was constructed with bovine serum albumin (BSA) and single stranded Deoxyribonucleic acid (ss-DNA) for the investigation of membrane separation efficiency. The membranes made of poly styrene (PS) and poly(methylmethacrylate) (PMMA) were fabricated by electrospinning and they were placed in syringe columns. By using the absorption spectroscopy, the sorption efficiency of membranes was determined. The electrospun membranes are promising for BSA uptake over a wide pH range. Under the same circumstances, thanks to PS fibers, ss-DNA uptake is very with respect to BSA uptake. Our results revealed that PS membranes show a better affinity to BSA molecules by hydrophobic interactions. In the mixture of BSA and ss-DNA, ss- DNA cannot be held on the surface of the membrane and pass through with low sorption efficiency. By altering the membrane amount in syringe column and modifiying the surface of the membranes, the separation could be enhanced. The proposed technology promises fast and effective separation of CNAs from whole blood and body fluids.en_US
dc.description.abstractHastalıkların teşhisi, bir kişinin sağlık durumu hakkında gerekli bilginin sağlanması için önemli bir faktördür. Kanser teşhisi için biyopsi, endoskopi, manyetik rezonans görüntüleme ve kan testleri gibi bir çok metot bulunmaktadır. Teşhiste en çok kullanılan araçlardan biri ise, insan vücudunda önemli bir yere sahip olan kandır. Kan tüm vücudu dolaşan bir sıvı bağ dokusudur ve içeriğinin %55’inde kan plazmasını bulundurur. Kan proteinlerinin serumdan uzaklaştırılması, kan testlerinde çok önemli bir basamaktır. Kanın içeriğinde bazı nükleik asitler hücre içinde bulunurken, bazıları hücre dışında serbest olarak dolanırlar. Araştırma sonuçları kanser hastalığında kanda serbest halde dolaşan bu nükleik asitlerin onkojenik ve tümör baskılayıcı olarak davrandıklarını göstermektedir. Genomik bölgelerde yer aldıklarından, sayılarındaki artış kanser hastalığının başlangıcıyla ilgili bir bağlantı kurulmasına olanak sağlamaktadır. Bu tezde kanda birlikte bulunan proteinler ve nükleik asitleri basit, ucuz ve de seçici bir yöntemle ayırmak amacıyla kullanmak için elektroeğirme tekniği ile hazırlanmış çeşitli polimerlerden, hedef biyomakromoleküle karşı seçici membran filtreler elde edilmiştir. Tek zincirli DNA ve Bovine Serum Albümini (BSA) kullanılarak hazırlanmış model bir sistem üzerinde elde edilen filtrelerin ayırma kapasitesi incelenmiştir. Elde edilen filtrelerin ayırma kapasitesi pH, filtre yüzeyindeki modifikasyonlar ve fiber çapı gibi parametreleri değiştirerek artırılmıştır. Hidrofobik filtrelerin proteinleri daha çok tutma özelliğine sahip olduğu ve filtre yüzeyine yapılan modifikasyonların ayırma kapasitesi üzerine büyük etkiye sahip olduğu gösterilmiştir.en_US
dc.language.isoengen_US
dc.publisherIzmir Institute of Technologyen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectCirculating nucleic acidsen_US
dc.subjectNucleic acids--Separationen_US
dc.subjectElectrospun membranesen_US
dc.subjectBlood—Analysisen_US
dc.titleCirculating nucleic acid (CNA) separation from serum by electrospun membranesen_US
dc.title.alternativeKanda serbest halde dolaşan nükleik asitlerin elektroeğirme lifler ile serumdan ayrılmasıen_US
dc.typemasterThesisen_US
dc.contributor.authorIDTR197000en_US
dc.contributor.departmentIzmir Institute of Technology. Materials Science and Engineeringen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record